野外实践日程安排
时间：2021年7月21日
9:00-9:30 DNA材料采集技术规范
9:30-17:00 野外采集分组实践
地点：昆明植物所1号门停车场集合，前往昆明近郊
一、实践目的
通过野外实操，掌握野外采集DNA材料、标本压制、图像拍摄、数据填写等技术和规范的要点。
二、工作目标
完成10号（每人单独完成1-2号）DNA单元的采集。
三、分组安排
组织协调：张 挺
A组领队：张 挺 13577059606
B组领队：刘 成 13577059606
C组领队：郭永杰 13987126536
D组领队：亚吉东 15925229625
四、注意事项
1. 参加人员须带相机、GPS；
2. 自备适合野外工作的衣物、鞋袜和防雨防晒用具等；
3. 自备个性化药物；培训过程中，身体若有不适反应请及时告知会务人员；
4. 野外实践海拔约2000米—2500米，处于云贵高原，请注意预防高原反应。
五、入选人员名单
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序号 |
姓名 |
单位 |
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A组 12人 领队：张挺 |
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1 |
李政隆 |
安徽大学资源与环境工程学院 |
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2 |
胡迎峰 |
安徽师范大学生命科学学院 |
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3 |
黄体冉 |
北京农学院 |
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4 |
李懿柔 |
成都中医药大学 |
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5 |
钟芙蓉 |
成都中医药大学 |
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6 |
李志芳 |
大理大学 |
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7 |
李宇泊 |
甘肃农业大学 |
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8 |
王 霞 |
甘肃农业大学 |
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9 |
莫良玉 |
广西大学 |
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10 |
黄世洋 |
广西大学 |
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11 |
梁 琼 |
广西大学 |
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12 |
陈海玲 |
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所 |
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B组 12人 领队：刘成 |
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13 |
张 娜 |
贵州中医药大学 |
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14 |
龙金兰 |
贵州中医药大学 |
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15 |
杨 灏 |
河南中医药大学 |
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16 |
练从龙 |
河南中医药大学 |
|
17 |
杨晶凡 |
河南中医药大学 |
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18 |
郭臻昊 |
江苏省农业科学院 |
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19 |
林彦君 |
昆明医科大学 |
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20 |
杨 珺 |
中国科学院昆明植物研究所 |
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21 |
李小玲 |
中国科学院昆明植物研究所 |
|
22 |
杨 智 |
南京林业大学 |
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23 |
王露露 |
南京林业大学 |
|
24 |
张明英 |
陕西中医药大学 |
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C组 12人 领队：郭永杰 |
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25 |
韩 彪 |
山东省林草种质资源中心 |
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26 |
刘 丹 |
山东省林木种质资源中心 |
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27 |
咸 洋 |
山东省林木种质资源中心 |
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28 |
王 茜 |
西南大学 |
|
29 |
樊智丰 |
西南林业大学 |
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30 |
孙大宽 |
西南林业大学 |
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31 |
钱丽珠 |
中国科学院西双版纳热带植物园 |
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32 |
朱映安 |
云南农业大学 |
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33 |
廖永坚 |
云南省林业和草原科学院 |
|
34 |
潘 莉 |
云南省林业和草原科学院 |
|
35 |
马维思 |
云南省农业科学院药用植物研究所 |
|
36 |
何 仟 |
中国疾病预防控制中心职业卫生与中毒控制所 |
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D组 12人 领队：亚吉东 |
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37 |
叶俊伟 |
中国科学院昆明植物研究所 |
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38 |
施银仙 |
中国科学院昆明植物研究所 |
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39 |
江 慧 |
中国科学院武汉植物园 |
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40 |
任 静 |
中国科学院武汉植物园 |
|
41 |
朱 杰 |
中国科学院西双版纳热带植物园 |
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42 |
陈馥艳 |
中国科学院西双版纳热带植物园 |
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43 |
杜 虎 |
中国科学院亚热带农业生态研究所 |
|
44 |
刘倩文 |
中国中医科学院中药研究所 |
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45 |
贺文瑞 |
中国中医科学院中药研究所 |
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46 |
张冬娟 |
中国科学院武汉植物园 |
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47 |
王朝英 |
重庆城市管理职业学院 |
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48 |
李政隆 |
安徽大学资源与环境工程学院 |
数据分析培训日程安排
时间：2021年7月22日 9:00-17:30
地点：昆明植物所行政楼三楼学术报告厅
一、培训目的
针对生物信息学背景较弱的研究生和科研人员，通过培训能快速并准确地掌握细胞器基因组de novo组装和注释，提高数据处理和分析能力。
二、培训目标
本次培训讲座和演练相结合，课程将会从软件包安装开始，逐步深入进行数据组装、处理和相关的多样性、物种鉴定和系统发育分析等。
三、培训内容安排
1. DNA 测序技术和质体基因组介绍
2. 细胞器基因组装软件GetOrganelle工作流程介绍
3. 叶绿体基因组结构变异和常见问题
4. 细胞器基因组注释方法
5. DNA序列比对方法和常用方法
四、培训团队
郁文彬，中国科学院西双版纳热带植物园，研究员
金建军，美国哥伦比亚大学，博士后
张志荣，中国科学院昆明植物研究所，工程师
五、注意事项
1. 参加人员需自带笔记本电脑，了解Linux 或 macOS常用操作命令；
2. 从事过DNA序列处理、比对和分析；
3. 了解高通量测序数据和de novo组装。
二代测序文库构建实践日程安排
时间：2021年7月23日 9:00-17:30
地点：昆明植物所中国西南野生生物种质资源库301实验室
一、实践目的
通过实验操作，掌握二代测序文库制备、质控的基本方法及操作技巧。
二、工作目标
每组完成2-4个标准DNA样品的二代测序文库制备、质控。
三、分组安排
组织协调：杨 静
A组领队：林春艳
B组领队：张金萍
C组领队：杨志云
D组领队：杨丽萍
四、注意事项
1. 参加人员严格遵守实验室的规章制度，不私自动用仪器及实验用品；
2. 实验操作时穿着实验服，佩戴实验手套；
3. 培训过程中，如遇身体不适请及时告知会务人员。
五、入选人员名单
|
序号 |
姓名 |
单位 |
|
1 |
朱 杰 |
中国科学院西双版纳热带植物园 |
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2 |
何 仟 |
中国疾病预防控制中心职业卫生与中毒控制所 |
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3 |
陈馥艳 |
中国科学院西双版纳热带植物园 |
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4 |
李宇泊 |
甘肃农业大学 |
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5 |
王 霞 |
甘肃农业大学 |
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6 |
刘 丹 |
山东省林木种质资源中心 |
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7 |
李政隆 |
安徽大学资源与环境工程学院 |
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8 |
黄体冉 |
北京农学院 |
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9 |
马维思 |
云南省农业科学院药用植物研究所 |
|
10 |
胡迎峰 |
安徽师范大学生命科学学院 |
|
11 |
韩 彪 |
山东省林草种质资源中心 |
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12 |
咸 洋 |
山东省林木种质资源中心 |
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13 |
郭臻昊 |
江苏省农业科学院 |
|
14 |
张 娜 |
贵州中医药大学 |
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15 |
龙金兰 |
贵州中医药大学 |
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16 |
李志芳 |
大理大学 |
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17 |
莫良玉 |
广西大学 |
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18 |
黄世洋 |
广西大学 |
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19 |
杨 珺 |
中国科学院昆明植物研究所 |
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20 |
李小玲 |
中国科学院昆明植物研究所 |
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21 |
樊智丰 |
西南林业大学 |
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22 |
杨 灏 |
河南中医药大学 |
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23 |
练从龙 |
河南中医药大学 |
|
24 |
叶俊伟 |
中国科学院昆明植物研究所 |
|
25 |
施银仙 |
中国科学院昆明植物研究所 |
|
26 |
江 慧 |
中国科学院武汉植物园 |
|
27 |
任 静 |
中国科学院武汉植物园 |
|
28 |
张冬娟 |
中国科学院武汉植物园 |
|
29 |
廖永坚 |
云南省林业和草原科学院 |
|
30 |
潘 莉 |
云南省林业和草原科学院 |
|
31 |
刘倩文 |
中国中医科学院中药研究所 |
|
32 |
杨晶凡 |
河南中医药大学 |
|
33 |
贺文瑞 |
中国中医科学院中药研究所 |
|
34 |
杜 虎 |
中国科学院亚热带农业生态研究所 |
|
35 |
朱映安 |
云南农业大学 |
|
36 |
钱丽珠 |
中国科学院西双版纳热带植物园 |
|
37 |
陈海玲 |
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所 |
|
38 |
梁 琼 |
广西大学 |
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39 |
杨 智 |
南京林业大学 |
|
40 |
孙大宽 |
西南林业大学 |
|
41 |
王露露 |
南京林业大学 |
|
42 |
林彦君 |
昆明医科大学 |
美迪康会务通